首先，吞拿鱼是金枪鱼的音译名称（tuna），所以，两者指的其实是同一种鱼。这种鱼还有个名称叫鲔鱼。大陆人一般说金枪鱼，台湾人会说鲔鱼，香港人则喜欢说吞拿鱼。
金枪鱼和三文鱼的区别还是很大的，主要表现在以下几个方面：
一、科属区别
1、金枪鱼：金枪鱼为动物界、脊索动物门、脊椎动物亚门、硬骨鱼纲、鲈形目、金枪鱼亚目、金枪鱼科、金枪鱼属大型远洋性重要商品食用鱼。
2、三文鱼：三文鱼为动物界、脊索动物门、脊椎动物亚门、辐鳍鱼纲、新鳍亚纲、鲑形目、鲑科、鲑属与鳟属溯河洄游性鱼类。
二、产地区别
1、金枪鱼：金枪鱼分布在印度洋、太平洋中部与大西洋中部等地，主要种类有鲣、蓝鳍金枪鱼、马苏金枪鱼、长鳍金枪鱼、黄鳍金枪鱼、大眼金枪鱼等。
2、三文鱼：三文鱼主要分布在太平洋北部及欧洲、亚洲、美洲的北部地区，主要种类有挪威三文鱼、芬兰三文鱼、美国三文鱼、大马哈鱼等。
三、形态区别
1、金枪鱼：金枪鱼的体形较长，粗壮而圆，呈流线形，向后渐细尖而尾基细长，尾鳍为叉状或新月形，尾柄两侧有明显的稜脊，背、臀鳍后方各有一行小鳍，具有鱼雷体形，其横断面略呈圆形。
2、三文鱼：三文鱼的体形侧扁，背部隆起，齿尖锐，鳞片细小，银灰色，产卵期有橙色条纹，肉质紧密鲜美，肉色为粉红色并具有弹性，鳞小刺少。
四、口感区别
1、金枪鱼：金枪鱼属于深海鱼，特点是肉质柔嫩鲜美，蛋白质含量高，但脂肪含量很低，俗称海底鸡。
2、三文鱼：三文鱼属于淡水鱼，特点是肉肥，颜色鲜艳，口感润滑，入口即化，适合东方人的口感要求，同时还含有很多维生素和矿物质，是人们很容易吸收和利用的营养素。就营养价值来说，因为多为养殖，所以较深海原生的三文鱼营养大打折扣。
五、功效区别
1、金枪鱼：金枪鱼味甘，性平，归肝、肾经，具有强化肝脏功能、防止动脉硬化的功效，适宜于心脑血管疾病，同时也是女性美容、减肥的健康食品。
2、三文鱼：三文鱼味甘，性温，归胃经，具有补虚劳、健脾胃、暖胃和中的功效，适宜于消瘦、水肿、消化不良等症。
通俗一点讲，金枪鱼和三文鱼的区别就是五花肉与肥肉的区别。但是，金枪鱼的营养价值是更高一些的，味道也更加鲜嫩一点。因此，金枪鱼要比三文鱼相对贵一些。
金枪鱼价格浮动比较大，零下20度的大约是160元每公斤，零下60度的是380元每公斤。
所有的三文鱼都是冰鲜的（速冻的），价格要看三文鱼的产地。
目前超市的价格是：
—挪威（零售价约每公斤130元）
—加拿大（零售价约每公斤145元）
—-丹麦（零售价约每公斤150元）
尽管金枪鱼营养更高更好吃，然而由于金枪鱼纤维含量丰富，中低价格的金枪鱼口感反而不及三文鱼润滑，所以目前在国内市场上还是三文鱼比较普及比较受欢迎。